| 開催回 | 開催年 | 会長（所属） | 開催地 |
|---|---|---|---|
| １ | 平成０２年（1990） | 茂田士郎 （福島医大） | 東京 |
| ２ | 平成０３年（1991） | 池本秀雄 （順天堂大） | 東京 |
| ３ | 平成０４年（1992） | 加地正郎 （呉共済病院） | 呉 |
| ４ | 平成０５年（1993） | 小野克彦 （愛知県がんセンター） | 名古屋 |
| ５ | 平成０６年（1994） | 高須俊明 （日大） | 東京 |
| 6 | 平成０７年（1995） | 山本直樹 （東京医科歯科大） | 東京 |
| 7 | 平成０８年（1996） | 茂田士郎 （福島医大） 第９回国際抗ウイルス会議との合同開催 | 裏磐梯 |
| 8 | 平成０９年（1997） | 伊藤正彦 （山梨医大） 実吉峯郎 （帝京科学大） | 甲府 |
| 9 | 平成１０年（1998） | 塩田 洋 （徳島大） | 徳島 |
| 10 | 平成１１年（1999） | 宮坂 貞 （昭和大） | 東京 |
| 11 | 平成１２年（2000） | 馬場昌範 （鹿児島大） 第８回国際抗ウイルスシンポジウム・ ワークショップと合同開催 | 鹿児島 |
| 12 | 平成１４年（2002） | 臼井正彦 （東京医大） | 東京 |
| 13 | 平成１５年（2003） | 町田治彦 （ヤマサ醤油） 高久 洋 （千葉工大） | 習志野 |
| 14 | 平成１６年（2004） | 西山幸廣 （名古屋大） | 名古屋 |
| 15 | 平成１７年（2005） | 馬場昌範 （鹿児島大） | 屋久島 |
| 16 | 平成１８年（2006） | 錫谷達夫 （福島医大） | 福島 |
| 17 | 平成１９年（2007） | 丸山徳見 （徳島文理大） | 高松 |
| 18 | 平成２０年（2008） | 榮鶴義人 (鹿児島大） | 霧島 |
| 19 | 平成２１年（2009） | 田中博道 （昭和大） | 東京 |
| 20 | 平成２２年（2010） | 満屋裕明 （熊本大学） | 熊本 |
| 21 | 平成２３年（2011） | 村山次哉 （北陸大学） | 金沢 |
| 22 | 平成２４年（2012） | 馬場昌範 （鹿児島大） 第２５回国際抗ウイルス会議と合同開催 | 札幌 |
| 23 | 平成２５年（2013） | 岡 慎一 （国立国際医療研究センター） | 東京 |
| 24 | 平成２６年（2014） | 榎本信幸 （山梨大学） | 富士 吉田 |
| 25 | 平成２７年（2015） | 西條政幸 （国立感染症研究所） | 東京 |
| 26 | 平成２８年（2016） | 田中靖人 （名古屋市立大学） | 名古屋 |
| 27 | 平成２９年（2017） | 前田賢次 （国立国際医療研究センター） | 熊本 |
| 28 | 平成３０年（2018） | 坂本直哉 （北海道大学） | 札幌 |
| 29 | 令和 １年（2019） | 原口一広 （日本薬科大学） | 東京 |
| 30 | 令和 ４年（2022） | 満屋裕明 （国立国際医療研究センター） | 京都 |
| 31 | 令和 ５年（2023） | 考藤達哉 （国立国際医療研究センター） | 横浜 |